Struktura pionu naukowego Instytutu Slawistyki złozona jest z czterech zakładów. W każdym Zakładzie funkcjonują zespoły tematyczne, odpowiedzialne za wykonywanie tematów statutowych Instytutu. W Instytucie Slawistyki badania naukowe realizowane są w formie badań statutowych, badań niestatutowych oraz grantów.