Uniwersytet Warszawski

Instytut Slawistyki wzmacnia więzi z warszawską slawistyką uniwersytecką. Najszersze kontakty utrzymuje z Instytutem Slawistyki Zachodniej i Południowej na Wydziale Polonistyki UW. Współpraca obejmuje zarówno organizację konferencji naukowych, (ostatnią była zorganizowana w marcu 2010 sesja międzynarodowa Wokół religii i jej języka), seminariów serbołużyckich, jak i współfinansowanie publikacji. Istotnym elementem działania obu placówek jest wspólna polityka w zakresie gromadzenia, przechowywania i udostępniania zbiorów bibliotecznych - biblioteki IS PAN i Instytutu Slawistyki Zachodniej i Południowej UW znajdują się w tym samym budynku. Inną formą współpracy stanowi prowadzenie zajęć dydaktycznych w ISZiP przez pracowników IS PAN.

Natomiast szczegółową współpracę z Wydziałem Polonistyki UW w zakresie Studiów Doktoranckich przy Instytucie Slawistyki PAN określa podpisana umowa.

Akademia Pedagogiczna w Krakowie

Współpracę z Akademią Pedagogiczną w Krakowie wytycza realizacja międzynarodowego tematu badawczego: Gramatyka kognitywna bułgarsko-polsko-francuska, który koordynuje Instytut Slawistyki PAN. Uczelnia współfinansowała jeden z numerów Etudes cognitives / Studia kognitywne i organizowała konferencję, związaną z problematyką projektu. W ramach umowy między IS PAN i AP w Krakowie wydano wspólnie zbiór studiów prof. Stanisława Karolaka.

Uniwersytet Śląski

Instytut Romanistyki Uniwersytetu Śląskiego uczestniczy w realizacji tematu badawczego Gramatyka kognitywna bułgarsko-polsko-francuska (zob. wyżej), współfinansował jeden z numerów Etudes cognitives / Studia kognitywne.

Uniwersytet Muzyczny im. Fryderyka Chopina w Warszawie

W ramach współpracy zorganizowano kilka konferencji naukowych, wśród nich sesje poświecone problematyce milczenia. Wygłoszone referaty zostały opublikowane w dwóch znaczących tomach, Semantyka milczenia, pod redakcją Kwiryny Handke. Ostatnią wspólną konferencję, tym razem poświęconą wybranym aspektom twórczości Stefana Żeromskiego („Stefan Żeromski wobec niepodległości"), zorganizowano w listopadzie 2009. 

Collegium Civitas w Warszawie

Instytut Slawistyki PAN jest jednym z pięciu instytutów patronackich Collegium Civitas. Zasady współpracy między Instytutem a tą uczelnią zawarte w umowie o współpracy umożliwiają m.in. doktorantom IS PAN udział w zajęciach prowadzonych w CC.

Uniwersytet Marii Curie-Skłodowskiej w Lublinie

Na podstawie zawartej umowy między Instytutem Slawistyki PAN a Instytutem Filologii Polskiej UMCS wspólny Zespół Etnolingwistyczny realizuje projekt badawczy Słownik stereotypów i symboli ludowych.

Państwowa Wyższa Szkoła Zawodowa w Gorzowie Wielkopolskim

Instytut Slawistyki PAN objął patronat nad Centrum Badań Euroregionalnych, który został powołany w strukturach Państwowej Wyższej Szkoły Zawodowej w Gorzowie Wielkopolskim. Badania dotyczące pogranicza polsko-niemieckiego w ramach Euroregionu „Pro Europa Viadrina" oraz innych obszarów pogranicznych w Polsce i w Europie owocują wspólnymi projektami badawczymi, organizowaniem seminariów i konferencji (zbiór tekstów z ostatniej konferencji, Europa - Slavia - Germania. W poszukiwaniu tożsamości, ukazał się w 2009 r.)